В. В. Шестаков родился 9 октября 1950 года. В 1974 году с отличием окончил Пермский государственный медицинский институт. Трудовую деятельность начал санитаром приемного покоя Пермской областной психиатрической больницы № 1 в 1971 году, по окончании института работал цеховым врачом городской поликлиники № 1 города Перми. В 1976 году он получил должность ассистента кафедры нервных болезней лечебного факультета. В 1979 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Сосудистое обеспечение головного мозга и коррекция гемодинамических нарушений у больных эпилепсией».

С 1982 года В. В. Шестаков доцент кафедры нервных болезней лечебного факультета, в 1982 году ему присвоено звание доцента по кафедре нервных болезней, в 1992 году он избран по конкурсу на вакантную должность доцента кафедры неврологии ФУВ.  Это время являлось организационным для курса неврологии ФУВ, В. В. Шестаков полностью подготовил лекционный курс для пятимесячного цикла первичной специализации по неврологии для всех 5-ти циклов тематического усовершенствования, к каждому из них разработал календарный и рабочий планы, подготовил экзаменационные билеты для всех циклов, преподаваемым на курсе.

В 1995 году В. В. Шестаков избран по конкурсу на замещение вакантной должности заведующего кафедрой неврологии ФУВ. В 1996 году защитил докторскую диссертацию на тему «Гемодинамические и адаптационные механизмы формирования сосудистых заболеваний мозга». В 1998 году ему присвоено звание профессора по кафедре неврологии.

Профессор В. В. Шестаков автор и соавтор  более 150   работ, 2  изобретений, 4 монографий, 20 учебно-методических пособий. Под его руководством защищены 1 докторская и 7 кандидатских диссертаций. Основное научное направление – исследования, касающиеся цереброваскулярных заболеваний.